Exame de FAN com padrão pontilhado fino denso é altamente específico para o diagnóstico de Lúpus Eritematoso Sistêmico e em títulos altos está correlacionado a maior gravidade no curso da doença.

Presença de anticorpos anti-peptídeoscitrulinados (Anti CCP) e fator reumatoide em altos títulos estão associados a pior prognóstico para Artrite Reumatoide.

A ausência de HLA B27 exclui o diagnóstico de espondilite anquilosante.

A ressonância magnética de articulação sacroilíaca pode ser útil no diagnóstico da artrite reumatoide.