Os antipsicóticos atípicos são mais eficazes no tratamento dos sintomas negativos, como a anedonia e a retração social, pois afetam tanto os receptores dopaminérgicos quanto os serotonérgicos, equilibrando os níveis de neurotransmissores.

Os antipsicóticos atípicos apresentam uma taxa de efeitos extrapiramidais significativamente mais alta, o que pode levar a uma maior incidência de discinesia tardia e parkinsonismo, dificultando a adesão ao tratamento a longo prazo.

Os antipsicóticos atípicos são menos eficazes na redução de sintomas positivos, como delírios e alucinações, mas são preferidos devido ao menor risco de desenvolver efeitos colaterais metabólicos como ganho de peso e hiperglicemia.

Os antipsicóticos atípicos têm efeito exclusivo nos receptores de dopamina, ao contrário dos antipsicóticos típicos que também afetam os receptores serotoninérgicos, resultando em uma eficácia menor para o tratamento global da esquizofrenia.