Na síndrome da enterocolite induzida por proteína alimentar, uma hipersensibilidade gastrointestinal a alimentos mediada por IgE, deve ser considerada, por sua gravidade, assim como a reação anafilática, uma urgência entre as crianças com APLV.

Os pacientes portadores de proctite ou proctocolite alérgicas são, em geral recém- nascidos e lactentes, em sua grande maioria em uso de leite materno exclusivo, sendo a reação causada pelas proteínas alimentares ingeridas pela mãe nutriz e presentes no leite materno.

Nas enteropatias induzidas por proteínas alimentares, pode-se observar um quadro de má absorção, de início insidioso, que pode se apresentar com diarreia crônica (fezes aquosas e ácidas), eritema perianal, distensão abdominal, vômitos, anemia, perda de peso e insuficiência do crescimento. Nesse caso, a família deve ser informada que a criança possui alergia à lactose e o tratamento consiste na dieta de restrição da proteína do leite de vaca.

O tratamento da APLV baseia-se na exclusão das proteínas do leite de vaca da dieta, devendo-se também evitar a inalação e o contato com a pele, e manter as necessidades nutricionais do paciente. Para os recém-nascidos e lactentes em aleitamento materno, recomenda-se substituição do aleitamento por fórmulas de partida.