Em pacientes com endocardite predominante de valva tricúspide, está indicada a anticoagulação, visto que esse paciente tem alto potencial para embolização para artéria pulmonar.

Em pacientes com endocardite de prótese valvar, principalmente precose, está fortemente indicada cirurgia de troca da mesma, visto que há forte potencial para complicações mecânicas. 

Na maioria dos pacientes com endocardite bacteriana, não se consegue encontrar um fator desencadeante como manipulação dentária, manipulação cirúrgica pélvica, infecções recentes de pele, uso de drogas endovenosas.

Legionella sp, Mycoplasma sp, Bartonella sp e Brucella sp são exemplos de germes que podem raramente causar endocardite e estão associados à negatividade de hemoculturas.