Os agentes predominantes são cocos Gram-positivos, mais comumente o S. epidermidis resistente à Meticilina, S. aureus resistentes à Meticilina e enterococos.

Vancomicina e Linezolida são os antibióticos de escolha para infecção primária da corrente sanguínea por S. Aureus Meticilina Resistentes.

Em pacientes receptores de transplante de órgãos sólidos, a terapia inicial para fungos deve ser feita com uma equinocandina.

As infecções na corrente sanguínea causada pelo Stafilococos aureus requerem uma semana de tratamento.