Devido à extensa reatividade cruzada com outros Flavivírus, principalmente o vírus da Dengue, a sorologia não define o diagnóstico em áreas endêmicas para Dengue ou em populações extensamente vacinadas para a Febre Amarela. Alguns testes sorológicos, com elevada sensibilidade e especificidade documentada, apresentam resultados baseados em numero amostral excessivamente baixo, por exemplo 11 pacientes confirmados para ZIKV agudo, o que ainda impede maior generalização dos resultados até o momento.