O ultrassom 3D é vantajoso em diversas situações como fenda facial e micrognatia, e a maior parte dos diagnósticos feitos pelo método 3D não são feitas pela ultrassonografia bidimensional. 

A ressonância magnética é um método seguro e sem restrições para seu emprego na gestação em qualquer trimestre, inclusive com uso de contrastes.

As imagens obtidas por ressonância magnética não têm interferência da quantidade de líquido amniótico ou pela espessura da parede abdominal materna. 

 A ultrassonografia 3D e a ressonância magnética fetal são exames equivalentes na propedêutica pré-natal.