A fístula interesfinctérica é a mais rara.

Pela regra de Salmon-Goodsall, as fístulas que se abrem externamente na metade anterior do ânus geralmente dirigem-se para o canal anal, na própria metade anterior do ânus, através de trajeto simples e retilíneo.

A infecção geralmente tem origem na inflamação glandular das criptas anais.

A fístula extraesfinctérica apresenta uma abertura interna acima do nível do elevador do ânus.

As fístulas transesfincterianas com grande envolvimento do esfíncter externo do ânus devem ser tratadas através da colocação de reparo, com fio de seda 2, e secção de trajeto num segundo tempo.