A Amniocentese para obtenção de líquido amniótico e realização de PCR para T. gonddi é considerada padrão-ouro para o diagnóstico fetal.

A amniocentese deve ser realizada até no máximo 16 semanas de gestação para evitar que haja falso negativo.

O risco de perda fetal pela amniocentese situa-se entre 1 e 5 % de acordo com literatura atual.

Baseado apenas na amniocentese positiva para toxoplasmose já há indicação de interrupção da gestação.