O líquor normal exclui o diagnóstico de encefalite.

Deve-se sempre interromper o aciclovir em crianças com coleta de líquor feita em menos de 6 horas do início dos sintomas e que tenha PCR para herpes negativo.

Em casos com PCR no líquor para herpes negativo e que haja suspeita clínica para encefalite herpética, deve-se recoletar novo líquor em 48 horas sem suspensão do aciclovir.

O tratamento para encefalite por sarampo é feito com ganciclovir.