As três principais bacias hidrográficas de Goiás — Paranaíba, Tocantins e São Francisco — possuem extensões muito similares, sendo todas elas fundamentais para a piscicultura e o abastecimento público.

Embora a Bacia Hidrográfica do Rio São Francisco seja a mais vasta em Goiás, com extensão superior a 195.000 km², ela é predominantemente utilizada para irrigação agrícola, sem contribuição significativa para o abastecimento público ou industrial.

Goiás utiliza seus recursos hídricos principalmente para abastecimento público e agricultura, mas o Estado não possui reservas significativas de água subterrânea, o que pode criar um cenário de estresse hídrico.

Goiás possui uma diversidade de reservatórios hídricos subterrâneos, incluindo zonas fraturadas do substrato geológico pré-cambriano e depósitos quaternários, além de abrigar áreas de recarga para o Aquífero Guarani, que são essenciais para a sustentabilidade de seus usos hídricos.

A menor das bacias em Goiás, a do Rio Tocantins, cobre uma área de apenas 3.000 km², mas é predominantemente utilizada para os distritos agroindustriais e pisciculturas, tendo pouco impacto na cobertura territorial do estado quando comparada às outras bacias.