A baciloscopia direta do escarro é um método fundamental, porque permite descobrir as fontes mais importantes de infecção - os casos bacilíferos.

A baciloscopia direta do escarro deve ser sempre solicitada para os pacientes adultos que procurem o serviço de saúde por apresentarem queixas respiratórias ou qualquer outro motivo, mas que espontaneamente, ou em resposta ao pessoal de saúde, informem ter tosse e expectoração por duas semanas. 

A baciloscopia direta do escarro também deve ser sempre solicitada para os contatos de casos de tuberculose pulmonar bacilíferos que apresentem queixas respiratórias. 

Recomenda-se, para o diagnóstico, a coleta de duas amostras de escarro, uma por ocasião da primeira consulta e a segunda, independente do resultado da primeira, na manhã do dia seguinte ao despertar.