A identificação precoce da criança infectada verticalmente é essencial para o início da terapia antirretroviral e das profilaxias. Deve-se, porém, avaliar cuidadosamente, pois a toxicidade destes medicamentos é muito maior nas crianças abaixo dos 5 anos de idade. 

Os testes rápidos em sangue, plasma ou fluído oral devem ser realizados principalmente para o diagnóstico da infecção aguda pelo HIV, pois são testes altamente sensíveis nesta situação.

A detecção da carga viral do HIV deve ser realizada em todos os pacientes HIV+.Valores muito altos, em geral acima de 100.000 cópias, estão fortemente relacionados a fases mais avançadas da infecção pelo HIV.

Para o diagnóstico da infecção pelo HIV, devem ser realizados 2 testes consecutivos,podendo ser testes rápidos, imunoensaios ou a detecção do RNA do HIV.