A PNEPS-SUS é orientada pelos seguintes princípios: diálogo; amorosidade;problematização; construção compartilhada do conhecimento; emancipação e compromisso com a construção do projeto democrático e popular.

Nessa Política, o diálogo é o encontro de conhecimentos construídos histórica eculturalmente por sujeitos, e acontece quando cada um, de forma respeitosa, coloca o que sabe à disposição para ampliar o conhecimento crítico de ambos acerca da realidade, contribuindo com os processos de transformação e de humanização.

São eixos estratégicos da PNEPS-SUS: participação, controle social e gestãoparticipativa; formação, comunicação e produção de conhecimento; cuidado em saúde e intersetorialidade e diálogos multiculturais.

Um dos objetivos específicos da PNEPS-SUS é promover a troca entre práticas esaberes populares e técnico-científicos no âmbito do SUS, aproximando os sujeitos da gestão, dos serviços de saúde, dos movimentos sociais populares, das práticas populares de cuidado e das instituições formadoras.

A fim de manter a verticalização do conhecimento, o que é de extrema importânciapara a garantia do respeito, a PNEPS – SUS evita fortalecer os movimentos sociais populares, os coletivos de articulação social e as redes solidárias de cuidado e promoção da saúde, já que estaria estimulando a criticidade e a reflexão dos envolvidos, o que, segundo Paulo Freire, não é aconselhável.