Uma das causas mais frequentes de diarreia crônica é a diarreia funcional, que provoca desidratação grave e desnutrição.

A terapêutica com zinco foi considerada benéfica e, de acordo com a Organização Mundial de Saúde (OMS), deve ser usado em menores de cinco anos de idade, durante o período de dez a quatorze dias, sendo iniciado a partir do momento da caracterização da diarreia.

O uso de probióticos, principalmente de Lactobacillus rhamnosus GG e Saccharomyces boulardii, diminui drasticamente o tempo de duração do quadro e o tempo de hospitalização dos pacientes.

O uso de antidiarreicos, como, por exemplo, adsorventes e anticolinérgicos, tem eficácia comprovada na diminuição da duração do quadro.

O uso de antiparasitários e antibióticos pode e deve ser efetuado em todos os casos de diarreia aguda.