Os marcadores sorológicos pANCA (anticorpos contra estruturas citoplasmáticas do neutrófilo) e ASCA (anticorpo contra Saccaharomyces cerevisiae) definem diagnóstico de doença de Crohn e RCUI, respectivamente.

O enema opaco e o exame de trânsito intestinal podem contribuir no diagnóstico tanto da RCUI quanto da doença de Crohn e são indicados na fase aguda das doenças.

Na RCUI, o cólon distal está sempre acometido da doença, as lesões são segmentares (saltadas) e a presença de pseudopólipos é comum.

A doença de Crohn pode acometer desde a boca até o ânus e apresenta doenças perianais, como abscesso e fistulas, mais frequentes do que na RCUI

O megacólon tóxico é uma compilação grave da doença de Crohn, com taxas de mortalidade de até 50% dos casos