O objetivo principal da Vigilância Epidemiológica é fornecer orientação técnica permanente para os profissionais de saúde. É ela quem tem a responsabilidade de decidir sobre a execução de ações de controle de doenças e agravos, tornando disponíveis as informações.

A partir de dados confiáveis, a VE é capaz de identificar a ocorrência de diversos agravos, mas os principais são: qualquer emergência, surtos e epidemias; emergências de saúde pública de interesse nacional.

A VE é responsável pela formulação da política de medicamentos, equipamentos, imunobiológicos e outros insumos de interesse para a saúde.

Faz parte da Vigilância Epidemiológica o controle de bens de consumo que, direta ou indiretamente se relacionem com a saúde, compreendidas todas as etapas e processos, da produção ao consumo.

A VE participa da formulação da política e na execução de ações de saneamento básico.