Maior de 60 anos, leucocitose "maior que" 30.000, secundária a mielodisplasia, são fatores de mau prognóstico.

A presença de alterações citogenéticas, tais como t (8;21), t (15;17) e inv (16) , confere prognóstico favorável.

Os subtipos M4 e M5 apresentam maior risco de infiltração de sistema nervoso central.

O subtipo M4 variante eosinofílica é de prognóstico desfavorável.

A t (9;22) confere melhor prognóstico.