I. Os epítopos correspondem apenas às sequências de aminoácidos na estrutura primária da proteína que são reconhecidas diretamente pelo anticorpo.

II. Há epítopos conformacionais, formados por aminoácidos não adjacentes na estrutura primária, mas que, com o dobramento da proteína, ficam próximos espacialmente.

III. Os epítopos podem ser neoantigênicos se formados após a proteólise da proteína em sua conformação normal, o que permite o desenvolvimento de novos anticorpos contra ela.

IV. Os epítopos conformacionais correspondem às sequências de aminoácidos a estrutura primária da proteína que são reconhecidos diretamente pelo anticorpo.

V. Os epítopos podem ser repetidos ao longo da estrutura de uma macromolécula.