O representante do Conselho Nacional de Secretários de Saúde (Conass) preside a Conferência Nacional de Saúde.

As Conferências de Saúde e os Conselhos de Saúde têm sua organização e suas normas de funcionamento definidas em regimento próprio, aprovadas pelo respectivo conselho.

As conferências de saúde passaram a contar apenas com as fases estadual e federal desde 2020.

As conferências de saúde realizam-se bienalmente e contam com a participação de diferentes segmentos sociais, entre os quais há representantes religiosos.

Os conselhos de saúde, de caráter consultivo, reúnem-se mensalmente.