Mães com tuberculose ativa devem ser orientadas a interromper a amamentação até completarem 2 semanas de tratamento, pois, nesse período, o Mycobacterium pode ser transmitido pelo leite materno.

Na doença de Chagas, o parasita pode ser excretado no leite humano e a infecção aguda no lactente causa sequelas cardíaca tardias. Assim, a amamentação deverá ser contraindicada, mesmo na fase crônica a da doença.

O vírus da hepatite C pode ser transmitido por fissuras mamárias e pelo colostro. Portanto, evitar a amamentação diminui significativamente o risco de transmissão vertical da doença.

A infecção por HTLV contraindica o aleitamento materno, porém uma vez que amamentação esteja estabelecida, não deve ser interrompida, que já o risco de transmissão não tem relação com a duração da amamentação.

O citomegalovírus pode ser transmitido pelo leite materno. Entretanto, a infeção materna não contraindica a amamentação de recém-nascidos a termo, devido ao caráter benigno da infecção adquirida nesses lactentes.