O ciclo é dividido em duas fases: folicular e lútea, sendo que a fase folicular começa com o início da menstruação e termina no dia anterior ao aumento do Hormônio Luteinizante (LH) e a fase lútea começa no dia do pico de LH e termina no início da próxima menstruação.

As concentrações séricas de Hormônio Folículo-Estimulante (FSH) e LH estão diminuindo nesse momento (fase folicular tardia) devido aos efeitos de feedback negativo do estradiol e talvez de outros hormônios liberados pelo ovário.

O aumento das concentrações séricas de estradiol resulta na proliferação do endométrio uterino, que se torna mais espesso, com um aumento no número de glândulas e o desenvolvimento de um padrão de "tripla faixa" ao ultrassom.

O Hormônio Antimülleriano (HAM) sérico tem sido usado como um potencial marcador de saúde e envelhecimento ovariano, secretado por pequenos folículos antrais, se correlaciona com o número total desses folículos ovarianos e apresenta grande variabilidade ao longo do ciclo menstrual.