A detecção de anticorpos anti-HIV reagente em crianças menores de dezoito meses de idade é suficiente para o diagnóstico de infecção pelo HIV. 

Se a carga viral do HIV for detectável dentro das primeiras 48 horas de vida, exclui-se infecção intraútero e considera-se somente contaminação pós-parto.

Caso a primeira carga viral do HIV, coletada com quatro a seis semanas de vida do recém-nascido, tenha resultado indetectável, deverá, mesmo assim, ser repetida após o quarto mês de vida.

Nas crianças acima de dezoito meses de idade, um único teste rápido reagente para o HIV em casos suspeitos encerra a investigação e fecha o diagnóstico de infecção pelo HIV.

A profilaxia para o neonato com uso de A ZT (zidovudina) não está indicada se as mães, durante a gestação, fizeram uso adequado de terapia antirretroviral para o HIV.