A doença de Crohn começa no reto e pode se estender, no sentido proximal, em um padrão contínuo, mas ela afeta apenas o cólon.

Os pacientes com retocolite desenvolvem úlceras aftosas, que são úlceras superficiais da mucosa. À medida que a doença progride, a ulceração se torna transmural e pode formar um padrão, ocorrendo do esôfago até o ânus.

A artropatia, que é a manifestação extraintestinal mais comum, afeta de 10 a 20% dos pacientes e sua exacerbação tem relação com a atividade da doença.

A positividade do marcador sorológico ASCA isoladamente é suficiente para o diagnóstico de doença de Crohn.

Nos casos de doença de Crohn, a colectomia total é curativa.