A degeneração maligna geralmente se dá para adenocarcinoma.

As células metaplásicas são mais resistentes à lesão proveniente do refluxo, porém são mais suscetíveis à malignização.

As cirurgias antirrefluxos não interferem no estágio da metaplasia já instalada. 

Ocorre substituição do epitélio escamoso estratificado pelo epitélio colunar intestinal.