A infecção por Clostridium difficile pode causar uma doença inflamatória por toxinas produzidas pela proliferação sem oposição da bactéria C. difficile. O uso de antibióticos ainda precede quase todos os casos de infecção e pacientes que recebem cursos prolongados de antibioticoterapia são particularmente suscetíveis. A diarreia aquosa é um sintoma característico e, em geral, começa durante ou pouco após o uso de antibiótico.