São fatores de risco para candidíase invasiva: neutropenia prolongada, antibioticoterapia de largo espectro, presença de cateter vascular, uso de NPT. 

A criptococose é a causa mais comum de meningite fúngica, especialmente em pacientes SIDA, em usuários de corticoide e em outras situações de imunossupressão. O fluconazol é recomendado como terapia inicial isolada para tratamento da meningite criptocócica aguda.

O tratamento de escolha para pneumocistose é o sulfametoxazol + trimetoprima, sendo indicado também o uso de prednisona nos casos mais graves, especialmente de hipoxemia. 

Existem diversas apresentações da aspergilose: aspergilose broncopulmonar alérgica, acometendo tipicamente pacientes com histórico de asma; aspergiloma, colonizando cavidades pulmonares preexistentes, como aquelas formadas pós-TB; aspergilose invasiva disseminada, típica de pacientes portadores de neoplasias hematológicas.