Os prebióticos são polissacarídeos específicos, facilmente hidrolisados pelas enzimas digestivas humanas, que servem de substrato para a fermentação microbiana no cólon.

Os simbióticos, que são a combinação de várias cepas de probióticos, são contraindicados em pacientes após transplantes de fígado.

Graças ao seu efeito de melhorar a resposta imunológica inata, os probióticos são bastante seguros, não tendo sido observado ainda efeito deletério com seu uso.

No cólon proximal, a fermentação proteolítica é a mais proeminente. 

Os probióticos inibem o crescimento de patógenos mediante a redução do pH intraluminal bem como pela secreção de bacteriocinas e defensinas.