O financiamento do SUS conta com recursos das três esferas de governo, portanto, não há solidariedade dos entes federados, mas sim cooperação.

O financiamento do SUS é subsidiado exclusivamente pela União, com recursos do orçamento da seguridade social, que os repassam aos estados e municípios preservando a utilização de impostos estaduais e municipais, que são direcionados exclusivamente para a educação.

Por determinação de lei complementar, cada esfera de governo está obrigada a destinar um percentual de recursos mínimos para o financiamento das ações e serviços do SUS.

A gestão do SUS se funda no comando de uma única esfera de governo, a União, nos estados e municípios o comando é do Ministério da Saúde.