A tireoidite de Hashimoto deve ter seu diagnóstico confirmado utilizando critérios clínicos e laboratoriais, além da Punção Aspirativa por Agulha Fina (PAAF).

O achado inicial mais frequente da Tireoidite de Hashimoto é um bócio dolorido e difuso, sendo que alguns indivíduos podem exibir apenas um lobo tireoidiano aumentado.

Eventualmente, o curso é marcado por sintomas de hipertireoidismo, especialmente durante a fase inicial da doença.

O Anticorpo Antiperoxidase (antiTPO) pode estar positivo em torno de 10% dos casos, sendo um marcador de pouca utilidade na prática.