A translocação bacteriana é a passagem de bactérias viáveis do trato gastrointestinal para tecidos estéreis, após ultrapassarem a barreira mucosa. 

A prevenção da translocação bacteriana está ligada ao tratamento exclusivo com antibióticos.

Obstrução intestinal, doenças inflamatórias intestinais, radioterapia, quimioterapia, hipovolemia e sepses são fatores que favorecem a translocação bacteriana. 

Nos pacientes graves em UTI, a redução do fluxo sanguíneo e disfuncionalização entérica por jejum prolongado fazem com que ocorra rapidamente atrofia da mucosa intestinal e perda da sua função de barreira.