É classificado em relação ao padrão temporal de apresentação como agudo, subagudo ou crônico: Agudo - Pacientes com TEP agudo geralmente desenvolvem sintomas e sinais imediatamente após a obstrução dos vasos pulmonares. Subagudo - Alguns pacientes com TEP também podem apresentar os sinais e sintomas dentro de dias ou semanas após o evento inicial. Crônico - Pacientes com TEP crônico desenvolvem lentamente sintomas de hipertensão pulmonar por muitos anos (ou seja, hipertensão pulmonar tromboembólica crônica).

É classificado em relação à presença ou ausência de estabilidade hemodinâmica: O TEP hemodinamicamente instável também é chamado de TEP de "alto risco". O TEP hemodinamicamente estável, é chamado de TEP "risco intermediário" se houver hipertensão associada do ventrículo direito ou TEP "de baixo risco" se não houver evidência de hipertensão ventricular direita. 

O TEP tem uma grande variedade de características de apresentação, que vão desde assintomáticos até choque ou morte súbita. Os sintomas de trombose venosa profunda em membros inferiores também podem estar presentes. O sintoma de apresentação mais comum é a hemoptise. Raramente se manifesta com dispneia seguida de dor torácica (tipicamente de natureza pleurítica) e tosse.

São considerados pacientes de risco para desenvolvimento de TEP: câncer, gestação, Síndrome Nefrótica, AVC, pacientes hospitalizados, dentre esses principalmente aqueles submetidos a cirurgias ginecológicas e ortopédicas como prótese de quadril e joelho.