A sedação é o principal efeito adverso e pode ser necessário ajuste nos horários das doses em caso de queixa do paciente.

Faz-se necessária a monitoração regular dos pacientes, independentemente da faixa etária.

Devem ser usados de forma cautelosa em pacientes portadores de doenças cardíacas, tais como alterações de condução.

A sertralina não deve ser usada em pacientes com doença hepática e durante a gestação.